El sistema actual de compensación bancaria en España es el denominado SNCE, supervisado por el Banco de España. El Sistema Nacional de Compensación Electrónica está abierto a todas las entidades de crédito operantes en España, y permite la compensación de toda clase de operaciones de intermediación de pagos.
Funcionamiento: consiste en el intercambio informático entre las entidades de los datos de las operaciones que tienen que compensar, obteniéndose para cada par de entidades un saldo neto que se liquida mediante el correspondiente abono o adeudo en las cuentas de tesorería que mantienen con el Banco de España.
El sistema español de compensación y liquidación bancaria se completa con el denominado Target-2 Banco de España para los grandes pagos en euros, tanto de operaciones nacionales como transfronterizas, con liquidación en tiempo real (Ley 41/1999).